Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PADI4Q9UM07 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PADI4Q9UM07 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms