Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRFN2Q9ULH4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms