Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NRXN1Q9ULB1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
NRXN1Q9ULB1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms