Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms