Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN2Q9UL51 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN2Q9UL51 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms