Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RIMS3Q9UJD0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms