Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABGEF1Q9UJ41 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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