Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAX2Q9UIW0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAX2Q9UIW0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms