Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MBD1Q9UIS9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms