Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPN3Q9UHW5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPN3Q9UHW5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms