Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NPC1L1Q9UHC9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NPC1L1Q9UHC9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms