Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGXB4Q9UGU5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGXB4Q9UGU5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms