Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCF20Q9UGU0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF20Q9UGU0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms