Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLKQ9UBT6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLKQ9UBT6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLKQ9UBT6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms