Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SAE1Q9UBE0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms