Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms