Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHD7Q9P2D1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms