Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMSAP3Q9P1Y5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAMSAP3Q9P1Y5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms