Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP1Q9NZU7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP1Q9NZU7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP1Q9NZU7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP1Q9NZU7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP1Q9NZU7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP1Q9NZU7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP1Q9NZU7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP1Q9NZU7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms