Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOP53Q9NZM5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms