Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RDH8Q9NYR8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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