Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C1orf109Q9NX04 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C1orf109Q9NX04 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms