Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO28Q9NVF7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO28Q9NVF7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms