Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GINM1Q9NU53 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINM1Q9NU53 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms