Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXD4L1Q9NU39 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXD4L1Q9NU39 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms