Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FARSBQ9NSD9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FARSBQ9NSD9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms