Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms