Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPRMQ9NS64 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms