Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LTBP3Q9NS15 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
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