Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS4Q9NRS4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPRSS4Q9NRS4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms