Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRAC1Q9NRG0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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