Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SH2B1Q9NRF2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms