Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGEF4Q9NR80 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF4Q9NR80 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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