Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf4Q9NR00 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms