Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPHNQ9NQX3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GPHNQ9NQX3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPHNQ9NQX3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms