Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC31BQ9NQW1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SEC31BQ9NQW1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC31BQ9NQW1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC31BQ9NQW1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC31BQ9NQW1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC31BQ9NQW1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms