Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LHX9Q9NQ69 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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LHX9Q9NQ69 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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LHX9Q9NQ69 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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LHX9Q9NQ69 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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LHX9Q9NQ69 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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LHX9Q9NQ69 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX9Q9NQ69 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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