Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCRT2Q9NQ03 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms