Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA4BQ9NPR2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms