Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms