Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPCPD1Q9NPB8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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