Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPHS2Q9NP85 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms