Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCM1Q9NP62 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCM1Q9NP62 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms