Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD33

MRPL47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL47Q9HD33 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL47Q9HD33 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL47Q9HD33 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms