Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLD4Q9HCU8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLD4Q9HCU8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms