Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAT1LQ9HCJ6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAT1LQ9HCJ6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAT1LQ9HCJ6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms