Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBX8Q9HC52 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms