Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPV4Q9HBA0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms