Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCSER2Q9H7U1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER2Q9H7U1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER2Q9H7U1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER2Q9H7U1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER2Q9H7U1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER2Q9H7U1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER2Q9H7U1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER2Q9H7U1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER2Q9H7U1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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