Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUDS3Q9H7L9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms